冷冻疗法会损害阴茎动脉血供 并损害负责勃起功能的海绵体神经。这种神经血管损伤合并导致40-100％的治疗患者阳痿，取决于使用多次冻融循环，产生的冰球大小，术前效力，使用的仪器等因素评估效力，以及自治疗以来的随访间隔。

冷冻治疗后可以比手术或放射治疗后更大的神经再生; 因此，据报道，一些患者在治疗后2年内恢复了勃起功能。一份报告表明，95％在冷冻疗法前有效的受试者变得无能为力，5％的受试者在平均16个月时恢复了效力。 

对1993年至1998年间在5所机构接受治疗的975名患者进行的汇总分析显示阳痿率为93％。然而，另一份报告指出冷冻消融后3年，38名受试者中有5名（13％）已恢复效力，13名（34％）在勃起辅助的帮助下有效。在一系列大型研究中，Jones等人指出，对于治疗时有效的患者（29.5％的患者），治疗后只有25％的患者恢复性交，只有8.8％的患者没有使用药物治疗或其他援助。

积极的阴茎康复在前列腺切除术后的勃起功能管理中越来越多，并且在冷冻疗法后也可能起作用。例如，Ellis等报道阴茎康复计划导致冷冻治疗后勃起功能恢复，41％的患者在1年时和51％在4年时恢复。

尽管如此，术后效力是生活质量领域，冷冻疗法明显不如前列腺癌的其他局部治疗方式。在效力恢复率提高之前，阳痿的风险可能继续成为阻碍勃起功能重要的患者更广泛使用冷冻疗法的障碍。

一组研究人员通过在前列腺冷冻期间使用基于活性氦的神经血管束变暖来研究在犬模型中保留神经的冷冻疗法的方法。不幸的是，神经保存不是完全可重复的; 此外，变暖还导致邻近神经的前列腺组织的不完全消融。